Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hpf1Q8CFE2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hpf1Q8CFE2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hpf1Q8CFE2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hpf1Q8CFE2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hpf1Q8CFE2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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