Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup88Q8CEC0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup88Q8CEC0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup88Q8CEC0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nup88Q8CEC0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup88Q8CEC0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup88Q8CEC0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup88Q8CEC0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Nup88Q8CEC0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nup88Q8CEC0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
Nup88Q8CEC0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup88Q8CEC0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup88Q8CEC0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup88Q8CEC0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup88Q8CEC0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup88Q8CEC0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nup88Q8CEC0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup88Q8CEC0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup88Q8CEC0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nup88Q8CEC0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup88Q8CEC0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms