Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc178Q8CDV0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc178Q8CDV0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc178Q8CDV0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc178Q8CDV0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc178Q8CDV0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc178Q8CDV0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc178Q8CDV0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc178Q8CDV0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc178Q8CDV0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc178Q8CDV0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc178Q8CDV0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc178Q8CDV0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc178Q8CDV0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc178Q8CDV0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms