Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc73Q8CDM4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc73Q8CDM4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc73Q8CDM4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc73Q8CDM4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc73Q8CDM4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc73Q8CDM4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc73Q8CDM4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc73Q8CDM4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc73Q8CDM4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc73Q8CDM4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc73Q8CDM4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc73Q8CDM4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc73Q8CDM4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc73Q8CDM4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc73Q8CDM4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc73Q8CDM4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc73Q8CDM4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms