Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vcpip1Q8CDG3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vcpip1Q8CDG3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vcpip1Q8CDG3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vcpip1Q8CDG3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vcpip1Q8CDG3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Vcpip1Q8CDG3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcpip1Q8CDG3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vcpip1Q8CDG3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vcpip1Q8CDG3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vcpip1Q8CDG3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vcpip1Q8CDG3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vcpip1Q8CDG3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vcpip1Q8CDG3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vcpip1Q8CDG3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vcpip1Q8CDG3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms