Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ephb1Q8CBF3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ephb1Q8CBF3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ephb1Q8CBF3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb1Q8CBF3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb1Q8CBF3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb1Q8CBF3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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