Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc159Q8C963 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc159Q8C963 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc159Q8C963 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc159Q8C963 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc159Q8C963 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc159Q8C963 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc159Q8C963 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc159Q8C963 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc159Q8C963 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc159Q8C963 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc159Q8C963 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc159Q8C963 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc159Q8C963 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms