Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoa5Q8C7G5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoa5Q8C7G5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apoa5Q8C7G5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoa5Q8C7G5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa5Q8C7G5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Apoa5Q8C7G5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms