Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ClmnQ8C5W0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ClmnQ8C5W0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ClmnQ8C5W0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ClmnQ8C5W0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ClmnQ8C5W0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ClmnQ8C5W0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ClmnQ8C5W0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ClmnQ8C5W0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ClmnQ8C5W0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ClmnQ8C5W0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ClmnQ8C5W0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ClmnQ8C5W0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ClmnQ8C5W0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ClmnQ8C5W0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ClmnQ8C5W0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ClmnQ8C5W0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ClmnQ8C5W0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ClmnQ8C5W0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ClmnQ8C5W0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ClmnQ8C5W0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ClmnQ8C5W0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ClmnQ8C5W0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ClmnQ8C5W0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ClmnQ8C5W0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ClmnQ8C5W0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ClmnQ8C5W0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ClmnQ8C5W0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ClmnQ8C5W0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ClmnQ8C5W0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ClmnQ8C5W0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ClmnQ8C5W0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ClmnQ8C5W0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ClmnQ8C5W0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ClmnQ8C5W0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ClmnQ8C5W0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ClmnQ8C5W0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ClmnQ8C5W0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms