Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sfrp1Q8C4U3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sfrp1Q8C4U3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sfrp1Q8C4U3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sfrp1Q8C4U3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfrp1Q8C4U3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfrp1Q8C4U3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfrp1Q8C4U3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfrp1Q8C4U3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sfrp1Q8C4U3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sfrp1Q8C4U3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sfrp1Q8C4U3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sfrp1Q8C4U3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sfrp1Q8C4U3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sfrp1Q8C4U3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms