Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Skor1Q8BX46 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Skor1Q8BX46 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Skor1Q8BX46 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Skor1Q8BX46 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Skor1Q8BX46 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Skor1Q8BX46 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Skor1Q8BX46 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Skor1Q8BX46 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Skor1Q8BX46 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Skor1Q8BX46 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Skor1Q8BX46 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Skor1Q8BX46 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Skor1Q8BX46 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Skor1Q8BX46 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Skor1Q8BX46 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Skor1Q8BX46 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Skor1Q8BX46 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Skor1Q8BX46 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Skor1Q8BX46 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Skor1Q8BX46 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Skor1Q8BX46 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Skor1Q8BX46 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms