Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dclk3Q8BWQ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dclk3Q8BWQ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dclk3Q8BWQ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dclk3Q8BWQ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dclk3Q8BWQ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dclk3Q8BWQ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dclk3Q8BWQ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dclk3Q8BWQ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dclk3Q8BWQ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dclk3Q8BWQ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dclk3Q8BWQ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dclk3Q8BWQ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dclk3Q8BWQ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dclk3Q8BWQ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dclk3Q8BWQ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dclk3Q8BWQ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms