Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm4aQ8BW72 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm4aQ8BW72 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm4aQ8BW72 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm4aQ8BW72 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Kdm4aQ8BW72 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm4aQ8BW72 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm4aQ8BW72 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm4aQ8BW72 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm4aQ8BW72 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm4aQ8BW72 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm4aQ8BW72 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm4aQ8BW72 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm4aQ8BW72 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Kdm4aQ8BW72 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm4aQ8BW72 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm4aQ8BW72 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm4aQ8BW72 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm4aQ8BW72 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm4aQ8BW72 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm4aQ8BW72 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm4aQ8BW72 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm4aQ8BW72 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm4aQ8BW72 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm4aQ8BW72 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm4aQ8BW72 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm4aQ8BW72 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm4aQ8BW72 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm4aQ8BW72 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm4aQ8BW72 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm4aQ8BW72 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm4aQ8BW72 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm4aQ8BW72 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms