Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Triml1Q8BVP1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Triml1Q8BVP1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Triml1Q8BVP1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Triml1Q8BVP1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Triml1Q8BVP1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Triml1Q8BVP1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Triml1Q8BVP1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Triml1Q8BVP1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Triml1Q8BVP1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Triml1Q8BVP1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Triml1Q8BVP1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Triml1Q8BVP1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Triml1Q8BVP1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Triml1Q8BVP1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Triml1Q8BVP1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Triml1Q8BVP1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Triml1Q8BVP1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Triml1Q8BVP1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Triml1Q8BVP1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Triml1Q8BVP1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms