Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo38Q8BMI0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxo38Q8BMI0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fbxo38Q8BMI0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo38Q8BMI0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo38Q8BMI0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo38Q8BMI0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo38Q8BMI0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbxo38Q8BMI0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxo38Q8BMI0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxo38Q8BMI0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo38Q8BMI0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo38Q8BMI0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms