Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Usp54Q8BL06 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Usp54Q8BL06 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Usp54Q8BL06 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Usp54Q8BL06 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Usp54Q8BL06 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Usp54Q8BL06 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Usp54Q8BL06 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Usp54Q8BL06 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Usp54Q8BL06 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Usp54Q8BL06 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Usp54Q8BL06 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Usp54Q8BL06 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Usp54Q8BL06 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Usp54Q8BL06 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Usp54Q8BL06 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Usp54Q8BL06 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Usp54Q8BL06 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Usp54Q8BL06 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Usp54Q8BL06 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Usp54Q8BL06 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Usp54Q8BL06 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Usp54Q8BL06 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Usp54Q8BL06 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Usp54Q8BL06 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Usp54Q8BL06 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Usp54Q8BL06 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Usp54Q8BL06 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Usp54Q8BL06 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Usp54Q8BL06 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Usp54Q8BL06 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Usp54Q8BL06 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Usp54Q8BL06 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Usp54Q8BL06 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Usp54Q8BL06 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Usp54Q8BL06 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Usp54Q8BL06 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Usp54Q8BL06 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Usp54Q8BL06 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Usp54Q8BL06 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Usp54Q8BL06 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Usp54Q8BL06 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Usp54Q8BL06 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Usp54Q8BL06 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Usp54Q8BL06 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms