Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp5Q8BKN5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp5Q8BKN5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tubgcp5Q8BKN5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp5Q8BKN5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubgcp5Q8BKN5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubgcp5Q8BKN5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms