Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbfox3Q8BIF2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbfox3Q8BIF2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbfox3Q8BIF2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbfox3Q8BIF2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms