Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Cdca8Q8BHX3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Cdca8Q8BHX3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Cdca8Q8BHX3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Cdca8Q8BHX3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Cdca8Q8BHX3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,56■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,56■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27,55■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,54■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,52■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27,52■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Cdca8Q8BHX3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Cdca8Q8BHX3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Cdca8Q8BHX3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cdca8Q8BHX3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cdca8Q8BHX3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cdca8Q8BHX3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms