Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH04

Pck2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pck2Q8BH04 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pck2Q8BH04 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pck2Q8BH04 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pck2Q8BH04 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pck2Q8BH04 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pck2Q8BH04 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pck2Q8BH04 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pck2Q8BH04 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pck2Q8BH04 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms