Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vipas39Q8BGQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vipas39Q8BGQ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vipas39Q8BGQ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vipas39Q8BGQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vipas39Q8BGQ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vipas39Q8BGQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vipas39Q8BGQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vipas39Q8BGQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vipas39Q8BGQ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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Vipas39Q8BGQ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vipas39Q8BGQ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vipas39Q8BGQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vipas39Q8BGQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vipas39Q8BGQ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vipas39Q8BGQ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vipas39Q8BGQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vipas39Q8BGQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vipas39Q8BGQ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vipas39Q8BGQ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vipas39Q8BGQ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vipas39Q8BGQ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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