Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH4

Reep1, Receptor expression-enhancing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep1Q8BGH4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Reep1Q8BGH4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Reep1Q8BGH4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep1Q8BGH4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep1Q8BGH4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep1Q8BGH4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep1Q8BGH4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep1Q8BGH4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Reep1Q8BGH4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep1Q8BGH4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Reep1Q8BGH4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Reep1Q8BGH4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Reep1Q8BGH4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms