Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubash3bQ8BGG7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubash3bQ8BGG7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubash3bQ8BGG7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubash3bQ8BGG7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms