Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Efr3aQ8BG67 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efr3aQ8BG67 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efr3aQ8BG67 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efr3aQ8BG67 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efr3aQ8BG67 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms