Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctdspl2Q8BG15 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctdspl2Q8BG15 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ctdspl2Q8BG15 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctdspl2Q8BG15 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctdspl2Q8BG15 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctdspl2Q8BG15 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ctdspl2Q8BG15 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ctdspl2Q8BG15 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctdspl2Q8BG15 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms