Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M10.6Q85ZW5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M10.6Q85ZW5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.6Q85ZW5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.6Q85ZW5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms