Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NanogQ80Z64 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NanogQ80Z64 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NanogQ80Z64 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NanogQ80Z64 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms