Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg2bQ80XK6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg2bQ80XK6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg2bQ80XK6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg2bQ80XK6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg2bQ80XK6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg2bQ80XK6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg2bQ80XK6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms