Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zbed4Q80WQ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zbed4Q80WQ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zbed4Q80WQ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbed4Q80WQ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbed4Q80WQ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbed4Q80WQ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zbed4Q80WQ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbed4Q80WQ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbed4Q80WQ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbed4Q80WQ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbed4Q80WQ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Zbed4Q80WQ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed4Q80WQ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zbed4Q80WQ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zbed4Q80WQ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Zbed4Q80WQ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Zbed4Q80WQ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zbed4Q80WQ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zbed4Q80WQ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zbed4Q80WQ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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