Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sestd1Q80UK0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sestd1Q80UK0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sestd1Q80UK0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sestd1Q80UK0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sestd1Q80UK0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sestd1Q80UK0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sestd1Q80UK0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sestd1Q80UK0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sestd1Q80UK0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sestd1Q80UK0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sestd1Q80UK0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sestd1Q80UK0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sestd1Q80UK0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sestd1Q80UK0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sestd1Q80UK0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sestd1Q80UK0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sestd1Q80UK0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sestd1Q80UK0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sestd1Q80UK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sestd1Q80UK0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sestd1Q80UK0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sestd1Q80UK0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sestd1Q80UK0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sestd1Q80UK0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms