Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp8Q80U87 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp8Q80U87 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp8Q80U87 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp8Q80U87 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp8Q80U87 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms