Protein–RNA interactions for Protein: Q80TS7

Ddn, Dendrin, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdnQ80TS7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DdnQ80TS7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DdnQ80TS7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DdnQ80TS7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DdnQ80TS7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DdnQ80TS7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms