Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

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Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CyldQ80TQ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CyldQ80TQ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CyldQ80TQ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CyldQ80TQ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CyldQ80TQ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CyldQ80TQ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CyldQ80TQ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CyldQ80TQ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CyldQ80TQ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CyldQ80TQ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CyldQ80TQ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CyldQ80TQ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CyldQ80TQ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CyldQ80TQ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CyldQ80TQ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CyldQ80TQ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CyldQ80TQ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CyldQ80TQ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CyldQ80TQ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CyldQ80TQ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CyldQ80TQ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CyldQ80TQ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CyldQ80TQ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CyldQ80TQ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CyldQ80TQ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CyldQ80TQ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CyldQ80TQ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CyldQ80TQ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CyldQ80TQ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CyldQ80TQ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CyldQ80TQ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CyldQ80TQ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CyldQ80TQ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CyldQ80TQ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CyldQ80TQ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CyldQ80TQ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CyldQ80TQ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CyldQ80TQ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms