Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sgo2Q7TSY8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sgo2Q7TSY8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sgo2Q7TSY8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sgo2Q7TSY8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgo2Q7TSY8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms