Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2lQ7TS74 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ckap2lQ7TS74 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ckap2lQ7TS74 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap2lQ7TS74 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap2lQ7TS74 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2lQ7TS74 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2lQ7TS74 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2lQ7TS74 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap2lQ7TS74 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ckap2lQ7TS74 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ckap2lQ7TS74 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ckap2lQ7TS74 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ckap2lQ7TS74 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ckap2lQ7TS74 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ckap2lQ7TS74 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ckap2lQ7TS74 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ckap2lQ7TS74 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ckap2lQ7TS74 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ckap2lQ7TS74 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms