Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS73

Rflna, Refilin-A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RflnaQ7TS73 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RflnaQ7TS73 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RflnaQ7TS73 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RflnaQ7TS73 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RflnaQ7TS73 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RflnaQ7TS73 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RflnaQ7TS73 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RflnaQ7TS73 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RflnaQ7TS73 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RflnaQ7TS73 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RflnaQ7TS73 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RflnaQ7TS73 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RflnaQ7TS73 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RflnaQ7TS73 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RflnaQ7TS73 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RflnaQ7TS73 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RflnaQ7TS73 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RflnaQ7TS73 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RflnaQ7TS73 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RflnaQ7TS73 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RflnaQ7TS73 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RflnaQ7TS73 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RflnaQ7TS73 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms