Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec4b1Q7TS58 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec4b1Q7TS58 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec4b1Q7TS58 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4b1Q7TS58 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4b1Q7TS58 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4b1Q7TS58 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4b1Q7TS58 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4b1Q7TS58 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4b1Q7TS58 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clec4b1Q7TS58 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec4b1Q7TS58 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec4b1Q7TS58 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec4b1Q7TS58 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clec4b1Q7TS58 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec4b1Q7TS58 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.1 ms