Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQC5

Aptx, Aprataxin, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AptxQ7TQC5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AptxQ7TQC5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AptxQ7TQC5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AptxQ7TQC5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AptxQ7TQC5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AptxQ7TQC5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AptxQ7TQC5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AptxQ7TQC5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AptxQ7TQC5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AptxQ7TQC5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AptxQ7TQC5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AptxQ7TQC5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AptxQ7TQC5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms