Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim46Q7TNM2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim46Q7TNM2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim46Q7TNM2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim46Q7TNM2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim46Q7TNM2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim46Q7TNM2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms