Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SugctQ7TNE1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SugctQ7TNE1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SugctQ7TNE1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SugctQ7TNE1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SugctQ7TNE1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SugctQ7TNE1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SugctQ7TNE1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SugctQ7TNE1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SugctQ7TNE1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SugctQ7TNE1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SugctQ7TNE1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SugctQ7TNE1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SugctQ7TNE1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SugctQ7TNE1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SugctQ7TNE1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SugctQ7TNE1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SugctQ7TNE1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SugctQ7TNE1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SugctQ7TNE1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SugctQ7TNE1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SugctQ7TNE1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SugctQ7TNE1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SugctQ7TNE1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SugctQ7TNE1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms