Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
HhipQ7TN16 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
HhipQ7TN16 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
HhipQ7TN16 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
HhipQ7TN16 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
HhipQ7TN16 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
HhipQ7TN16 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
HhipQ7TN16 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
HhipQ7TN16 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
HhipQ7TN16 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24,02■■□□□ 1,44
HhipQ7TN16 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24,01■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,97■■□□□ 1,43
HhipQ7TN16 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23,93■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23,92■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23,92■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23,91■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
HhipQ7TN16 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23,86■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
HhipQ7TN16 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,82■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23,82■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,82■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23,81■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23,8■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23,78■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23,77■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
HhipQ7TN16 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23,76■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,74■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23,73■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23,72■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23,71■■□□□ 1,39
HhipQ7TN16 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
HhipQ7TN16 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23,7■■□□□ 1,38
HhipQ7TN16 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23,7■■□□□ 1,38
HhipQ7TN16 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23,7■■□□□ 1,38
HhipQ7TN16 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
HhipQ7TN16 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
HhipQ7TN16 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
HhipQ7TN16 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23,69■■□□□ 1,38
HhipQ7TN16 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
HhipQ7TN16 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
HhipQ7TN16 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
HhipQ7TN16 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,2 ms