Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim12Q78RX3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim12Q78RX3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smim12Q78RX3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim12Q78RX3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim12Q78RX3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim12Q78RX3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim12Q78RX3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim12Q78RX3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim12Q78RX3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim12Q78RX3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim12Q78RX3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms