Protein–RNA interactions for Protein: Q78PG9

Ccdc25, Coiled-coil domain-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc25Q78PG9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc25Q78PG9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc25Q78PG9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc25Q78PG9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc25Q78PG9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc25Q78PG9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc25Q78PG9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms