Protein–RNA interactions for Protein: Q76KF0

Sema6d, Semaphorin-6D, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6dQ76KF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema6dQ76KF0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema6dQ76KF0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6dQ76KF0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6dQ76KF0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema6dQ76KF0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms