Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2r2Q6ZWZ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2r2Q6ZWZ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 532.9 ms