Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SpopQ6ZWS8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SpopQ6ZWS8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SpopQ6ZWS8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SpopQ6ZWS8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SpopQ6ZWS8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SpopQ6ZWS8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SpopQ6ZWS8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SpopQ6ZWS8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SpopQ6ZWS8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SpopQ6ZWS8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms