Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RfflQ6ZQM0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RfflQ6ZQM0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RfflQ6ZQM0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RfflQ6ZQM0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RfflQ6ZQM0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms