Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPT1

Klhl9, Kelch-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl9Q6ZPT1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl9Q6ZPT1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Klhl9Q6ZPT1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl9Q6ZPT1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl9Q6ZPT1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl9Q6ZPT1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl9Q6ZPT1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl9Q6ZPT1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl9Q6ZPT1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl9Q6ZPT1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl9Q6ZPT1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl9Q6ZPT1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl9Q6ZPT1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl9Q6ZPT1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl9Q6ZPT1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl9Q6ZPT1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl9Q6ZPT1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl9Q6ZPT1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl9Q6ZPT1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms