Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hsh2dQ6VYH9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hsh2dQ6VYH9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hsh2dQ6VYH9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hsh2dQ6VYH9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsh2dQ6VYH9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsh2dQ6VYH9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsh2dQ6VYH9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsh2dQ6VYH9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsh2dQ6VYH9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsh2dQ6VYH9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsh2dQ6VYH9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hsh2dQ6VYH9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hsh2dQ6VYH9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hsh2dQ6VYH9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms