Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sarm1Q6PDS3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sarm1Q6PDS3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sarm1Q6PDS3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sarm1Q6PDS3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sarm1Q6PDS3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms